Средновековната църква "Св. Богородица" се намира в южната част на кв. Църква на гр. Перник, при старите гробища.
Църквата е построена през късното средновековие  върху развалините на късноантична крепост, чиито стени и сега се виждат тук-таме.
Днес от средновековната църква е запазена само източната стена,която е била вградена в по-късна,възрожденска черква. Запазените незначителни части от старата сграда не позволяват да се определи първоначалния ѝ план. Сегашните размери са 10 м х 4,50 м, по малката ѝ ширина може да се причисли към късносредновековните църкви (XVI-XVII в.) от Горнострумския район. Старта църква е изградена от ломен камък с хоросанова спойка, с дебелина на стените 0,75 м. До апсидата е каноничната проскомидийна ниша, олтарното пространство се е осветявало от малко амбразурно прозорче в апсидата. Корабът най-вероятно е бил покрит с полуцилиндричен свод.
През 1940 г. части от стените в западната част на църквата се били унищожени при поправката на близкото шосе. Дълго време храмът е бил покрит с дъсчен покрив и керемиди,но отдавна и тях ги няма.
Най-вероятно църквата е била изцяло изписана отвътре, защото при изследването ѝ в средата на XX в.,под тогавашната мазилка(сега няма такава), се личали все още части от стенопис.
Църквата от старите гробища на кв. Църква е поредната старина нуждаеща се от възстановяване, но дали ще го дочака?!

Използвана литература:
1.Василиев,Асен-Църкви и манастири от Западна България,Разкопки и проичвания,т.IV,1950 г.
2.Митова-Джонова,Димитрина.Археологически паметници на Пернишки окръг,София,1983 г.